Генетик объяснил появление «Дельтакрона»

Генетик объяснил появление «Дельтакрона»

Генетик объяснил появление «Дельтакрона»

Штамм коронавируса «Дельтакрон», об обнаружении которого заявила группа ученых из лаборатории биотехнологии и молекулярной вирусологии Кипрского университета, скорее всего, результат лабораторной ошибки, сообщил в понедельник, 10 января, «Известиям» ученый-генетик Дмитрий Прусс, работающий в Солт-Лейк-Сити (США).

Штамм это значит: как «Омикрон» распространился в РФ за праздники
Эпидемиологи не исключают подъема заболеваемости после январских каникул
По его словам, чаще всего лаборатории наблюдают артефакты (ошибки) секвенирования из-за того, что в геноме «Омикрона» такое количество мутаций, что некоторые фрагменты генома часто вообще не удается прочитать без ошибок.

«Что-то типа «Дельтакрона» уже предполагали в геноме с острова Реюньон, но, скорее всего, это была просто проблема с ошибками секвенирования в плохо сохранившемся образце», — объяснил ученый.

Эксперт отметил, что в 2022 году ученые с Кипра загрузили 24 генома в базы GISAID. Автоматическая система всех их определила как «Дельту». При подробном рассмотрении первый же из них выглядит как «российская «Дельта» AY.122, но с добавочными мутациями, схожими с «Омикроном». Однако делать выводы о новом гипермутантном варианте преждевременно, добавил Прусс.

«Геномы коронавируса с Кипра загружают в международную базу редко. Между тем у них еще в ноябре пошла волна COVID-19, а в 20-х числах декабря жутко ускорилась — надо полагать, это «Омикрон» пошел по следам «Дельты». И вот на днях они загрузили 24 декабрьских генома. Все они — «Дельта» по автоматической классификации, но у всех есть делеция спайк-белка 69–70. По словам доктора Кострикиса (руководитель лаборатории, обнаружившей «Дельтакрон»), они наблюдали до 10 дополнительных мутаций, объединяющих новые геномы с «Омикроном». Я подозреваю, что это ошибка секвенирования в лаборатории, которая до того момента не прочитала ни одного генома «Омикрона». Пока более опытная лаборатория не подтвердит результаты, я остаюсь скептиком, — выразил мнение ученый.

По словам Прусса, десятки подобных «ошибочных» геномов находят ежедневно по всей планете, часто из образцов низкого качества, например из сточных вод.

Ранее в понедельник руководитель научной группы разработки новых методов диагностики на основе технологий секвенирования ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов заявил, что появление «Дельтакрона» может оказаться лабораторной ошибкой. Как отметил эксперт, получить смесь вариантов коронавируса можно при несоблюдении правил работы лаборатории. Например, если анализ проводился недостаточно опытным сотрудником.